研究テーマ(研究室紹介)

 当分野では、ヒト感染症の臨床的課題を解決するために、臨床で分離されるさまざまな細菌の病原因子と多様性を明らかにすることを主眼として分子疫学的研究・ゲノム解析の研究を進めています。
 また、医療関連感染の制御を目標とした地域連携組織である鹿児島感染制御ネットワークの事務局として鹿児島県の感染制御レベルの向上に努めるとともに、ワクチンの有効性を明らかにする疫学調査を通じて公衆衛生・予防医学に関わる研究にも取り組んでいます。

研究室概要

部局 大学院医歯学総合研究科 Graduate School of Medical and Dental Sciences
専攻 健康科学専攻 Health Research Course
大講座 感染防御学 Infection and Immunity
分野 微生物学 Microbiology
分野サイト  

 

連絡先

TEL.099-275-5276 / FAX.099-264-5643

主要研究テーマ

細菌の病原因子と多様性 Virulence factors and diversity of bacteria
細菌の分子疫学研究 Molecular epidemiology of bacteria
細菌のゲノム解析 Genome analysis of bacteria
感染制御の地域ネットワーク Local network of infection control
ワクチンの有効性に関する疫学調査 Epidemiological study on vaccine effectiveness

スタッフ


准教授
氏名

大岡唯祐 Tadasuke OOKA

mail: taohoka1(アットマーク)m.kufm.kagoshima-u.ac.jp

専門分野 細菌学、ゲノム微生物学
研究テーマ

・病原細菌の分子疫学
・病原細菌のゲノムおよびゲノム比較解析
・新興病原菌 Escherichia albertii の病原機構
・病原因子の水平伝播機構

研究者総覧 リポジトリ


助教
氏名 藺牟田直子 Naoko IMUTA
専門分野 臨床細菌学、分子疫学
研究テーマ ・下痢原性大腸菌の分子疫学
・腸管凝集性大腸菌の病原因子
・MRSA(メチシリン耐性黄色ブドウ球菌)の分子疫学
・細菌のバイオフィルム形成能

研究者総覧 リポジトリ

主な研究実績

大岡唯祐

 原著

  1. Ooka T, Arai S, Lee K, Gotoh Y, Kubomura A, Imuta N, Hara-Kudo Y, Iyoda S, Hayashi T, and Nishi J. Prevalence, sequence diversity and amplification of an IS-associated enterotoxin gene, astA, in Escherichia coli .  Frontiers in Microbiology, 2025,  16.  in press.
  2. Fernandes I, Ooka T, Lira D, Martins FH, Orsi H, Jones N, Elias W, Hayashi T, Gomes TA, and Hernandes R. TccP4: A novel effector identified in the Escherichia albertii strain 1551-2 required for attaching and effacing lesion formation on infected Nck-null cells. Microbiology Spectrum, 2025, Mar 4;13(3):e0205524. doi: 10.1128/spectrum.02055-24.
  3. Ooka T, Gotoh Y, Hatanaka S, Yoshimori M, Nishitarumizu K, Kojo K, Kosakamoto H, Sameshima K, Kuroki Y, Chibana N, Doi Y, Yoshino S, Harada T, Seto K, Ikeda T, Miyanohara H, Nakayama K, Gokuden M, Imuta N, Kawamura H, Ogura Y, Hayashi T, Nishi J.A Salmonella enterica serovar Oranienburg clone caused a cluster of bacteremia cases in persons with no recognizable underlying diseases in Japan. Open Forum Infect. Dis, 10:ofac695, 2023, doi: 10.1093/ofid/ofac695.
  4. Arai S, Ooka T, Shibata M, Nagai Y, Tokoi Y, Nagaoka H, Maeda R, Tsuchiya A, Kojima Y, Ohya K, Ohnishi T, Konishi N, Ohtsuka K, Hara-Kudo Y. Development of a novel real-time polymerase chain reaction assay to detect Escherichia albertii in chicken meat. Foodborne Pathog. Dis, 19:823-829, 2022. doi: 10.1089/fpd.2022.0042
  5. Nakae K, Ooka T, Murakami K, Hara-Kudo Y, Imuta N, Gotoh Y, Ogura Y, Hayashi T, Okamoto Y, Nishi J. Diversification of Escherichia albertii H-antigens and development of H-Genotyping PCR. Front. Microbiol, doi: 10.3389/fmicb.2021.737979. 2021.
  6. Ooka T, Seto K, Ogura Y, Nakamura K, Iguchi A, Gotoh Y, Honda M, Etoh Y, Ikeda T, Sugitani W, Konno T, Kawano K, Imuta N, Yoshiie K, Hara-Kudo Y, Murakami K, Hayashi T, Nishi J. O-antigen biosynthesis gene clusters of Escherichia albertii: their diversity and similarity to E. coli gene clusters and the development of an O-genotyping method. Microb. Genom, 5(11). doi: 10.1099/mgen.0.000314, 2019.
  7. Masuda K, Ooka T, Akita H, Hiratsuka T, Takao S, Fukada M, Inoue K, Honda M, Toda J, Sugitani W, Narimatsu H, Ishioka T, Hirai S, Sekizuka T, Kuroda M, Morita Y, Hayashi T, Kimura H, Oishi K, Ohnishi M, Fujimoto S, Murakami K. Epidemiological Aspects of Escherichia albertii Outbreaks in Japan and Genetic Characteristics of the Causative Pathogen. Foodborne Pathog. Dis, doi: 10.1089/fpd.2019.2654. 2019.
  8. Akter A,#, Ooka T#, Gotoh Y, Yamamoto S, Fujita H, Terasoma F, Kida K, Taira M, Nakadouzono F, Gokuden M, Hirano M, Miyashiro M, Inari K, Shimazu Y, Tabara K, Toyoda A, Yoshimura D, Itoh T, Kitano T, Sato MP, Katsura K, Mondal SI, Ogura Y, Ando S, Hayashi T: Extremely low genomic diversity of Rickettsia japonica distributed in Japan. Genome Biol. Evol, 9:124-133, 2016. (#: These authors contributed equally to this work.)
  9. Ooka T, Ogura Y, Katsura K, Seto K, Kobayashi H, Kawano K, Tokuoka E, Furukawa M, Harada S, Yoshino S, Seto J, Ikeda T, Yamaguchi K, Murase K, Gotoh Y, Imuta N, Nishi J, Gomes TA, Beutin L, Hayashi T. Defining the genome features of Escherichia albertii, an emerging enteropathogen closely related to Escherichia coli. Genome Biol Evol 7:3170-3179, 2015
  10. Ooka T, Tokuoka E, Furukawa M, Nagamura T, Ogura Y, Arisawa K, Harada S, Hayashi T. Human gastroenteritis outbreak associated with Escherichia albertii, Japan. Emerging infectious diseases 2013;19:144-146
  11. Ooka T, Seto K, Kawano K, Kobayashi H, Etoh Y, Ichihara S, Kaneko A, Isobe J, Yamaguchi K, Horikawa K, Gomes TA, Linden A, Bardiau M, Mainil JG, Beutin L, Ogura Y, Hayashi T. Clinical significance of Escherichia albertii. Emerging infectious diseases 2012;18:488-492
  12. Ooka T, Terajima J, Kusumoto M, Iguchi A, Kurokawa K, Ogura Y, Asadulghani M, Nakayama K, Murase K, Ohnishi M, Iyoda S, Watanabe H, Hayashi T. Development of a multiplex PCR-based rapid typing method for enterohemorrhagic Escherichia coli O157 strains. Journal of clinical f003-01 2009;47:2888-2894
  13. Ooka T, Ogura Y, Asadulghani M, Ohnishi M, Nakayama K, Terajima J, Watanabe H, Hayashi T. Inference of the impact of insertion sequence (IS) elements on bacterial genome diversification through analysis of small-size structural polymorphisms in Escherichia coli O157 genomes. Genome res 2009;19:1809-1816

 総説

  1. 大岡唯祐. 新興下痢症起因菌 Escherichia albertiiの特徴. 食品衛生研究 10月号 2020
  2. Gomes TA, Ooka T, Hernandes R, Yamamoto D, Hayashi T. Escherichia albertii pathogenesis. EcoSAL plus 9(1): doi: 10.1128/ecosalplus.ESP-0015-2019, 2020
  3. 大岡唯祐. 個別菌ゲノム解析(PacBioの利用,annotationやその他の問題点を含む). 化学療法の領域 33(7):44-50, 2017
  4. 大岡唯祐. 新興下痢症原因菌 Escherichia albertii. 日本食品微生物学会誌34(3):151-157, 2017

 著書

  1. 大岡唯祐.(担当:分担執筆)III. 細菌学各論 12. 腸内細菌科, エルシニア科と近縁菌群「総論」、「A. エシェリヒア属」、「B. 赤痢菌属」, 戸田新細菌学(改訂35版, 柳 雄介, 林 哲也, 山﨑 晶 (編)), 南山堂, 2025.

藺牟田直子
  1. Imuta N, Ooka T, Seto K, Kawahara R, Koriyama T, Kojyo T, Iguchi A, Tokuda K, Kawamura H, Yoshiie K, Ogura Y, Hayashi T, Nishi J. Phylogenetic Analysis of Enteroaggregative Escherichia coli (EAEC) Isolates from Japan Reveals Emergence of CTX-M-14-Producing EAEC O25:H4 Clones Related to Sequence Type 131. J Clin Microbiol 54(8):2128-2134, 2016
  2. Naito S, Takeuchi N, Ohkusu M, Takahashi-Nakaguchi A, Takahashi H, Imuta N, Nishi J, Shibayama K, Matsuoka M, Sasaki Y, Ishiwada N. Clinical and Bacteriologic Analysis of Nontypeable Haemophilus influenzae Strains Isolated from Children with Invasive Diseases, Japan, 2008-2015. J Clin Microbiol 56(7), 2018
  3. Kanno K, Yamaguchi H, Imuta N, Nishi J, Kasai M. Non-typeable Haemophilus influenzae purulent pericarditis in a healthy child. Pediatr Int 60(9):886-887, 2018
  4. Kawamura H, Tokuda K, Imuta N, Kubota T, Koriyama T, Miyanohara H, Hashiguchi T, Kawano Y, Nishi J. Epidemiological Analysis of Nosocomial MRSA Outbreaks Using Phage Open-Reading Frame Typing in a Tertiary-Care Hospital. Jpn J Infect Dis 2016;69(6):523-524
  5. Imuta N, Nishi J , Tokuda K, Fujiyama R, Manago K, Iwashita M, Sarantuya J, Kawano Y. Escherichia coli efflux pump TolC promotes aggregation of enteroaggregative E. coli 042. Infect Immun 2008;76(3):1247-1256
  6. Wakimoto N, Nishi J, Sheikh J, Nataro JP, Sarantuya J, Iwashita M, Manago K, Tokuda K, Yoshinaga M, Kawano Y. Quantitative biofilm assay using microtiter plate to screen for enteroaggregative Escherichia coli. Am J Trop Med Hyg 2004;71(5):687-690

主な研究費取得状況

大岡唯祐
事業・種目 / 期間 研究
科学研究費補助金
基盤研究(C)代表
令和6年度~令和8年度
新興下痢症起因菌Escherichia albertii の集団感染および水環境からの感染リスク解析
厚生労働科学研究費補助金
分担(代表:工藤由起子)
令和6年度〜令和8年度
食中毒原因病原大腸菌の検査法の整備および食中毒対策推進のための研究(食品の安全確保推進研究事業)
鹿児島大学全学プロジェクト・ミッション実現戦略分
令和4年度〜令和10年度
「奄美群島を中心とした『生物と文化の多様性保全』と『地域創生』の革新的融合モデル」
安全な農畜水産物安定供給のための包括的レギュラトリーサイエンス研究推進委託事業(農林水産省)
分担(代表:真瀬昌司)
令和3年度〜令和7年度
新たな人獣共通感染症の発生に備えた事前リスク評価(安全な農畜水産物安定供給のための包括的レギュラトリーサイエンス研究推進委託事業のうち課題解決型プロジェクト研究)
厚生労働科学研究費補助金
分担(代表:工藤由起子)
令和3年度〜令和5年度
食中毒原因細菌の検査法の整備のための研究(食品の安全確保推進研究事業)
科学研究費補助金
基盤研究(C)代表
令和2年度~令和4年度
Escherichia albertii の感染・増殖機構の解明
厚生労働科学研究費補助金
分担(代表:工藤由起子)
平成30年度〜令和2年度
食品中の食中毒細菌の制御法の確立のための研究(食品の安全確保推進研究事業)
厚生労働科学研究費補助金
分担(代表:大西 真)
平成29年度〜令和元年度
食品由来が疑われる有症事案に係る調査(食中毒調査)の迅速化・高度化に関する研究(食品の安全確保推進研究事業)
科学研究費補助金
基盤研究(C)代表
平成28年度~平成30年度
新興病原菌Escherichia albertiiの種特性と病原機構の解明
公益信託 児玉記念基礎医学助成基金
平成28年度助成金
平成28年度
新興下痢起因菌Escherichia albertiiのヒトに対する感染リスクの解析と病原株鑑別法の開発
科学研究費補助金
基盤研究(C)代表
平成25年度~平成27年度
新興病原体 Escherichia albertii の疫学および病原性の解明
藺牟田直子
事業・種目 / 期間 研究
科学研究費補助金
基盤研究(C)代表
令和7~令和9年度
妊婦用大腸菌ワクチン導入に向けた小児由来大腸菌の分子疫学解析と抗大腸菌抗体の検討
科学研究費補助金
基盤研究(C)代表
令和4~令和6年度
小児腸管内の病原・薬剤耐性遺伝子水平伝播におけるAtypical EAECの役割
科学研究費補助金
基盤研究(C)代表
令和元年~令和3年度
薬剤耐性化が進むK1大腸菌の系統解析とワクチン標的分子の探索
科学研究費補助金
基盤研究(C)代表
平成26~平成29年度
腸管凝集性大腸菌の凝集関連因子の同定と新規検査法の開発

分野サイト